Институт инжиниринга и строительства объектов использования атомной энергии (ИИС ОИАЭ)
Научно-исследовательский институт строительных материалов и технологий (НИИ СМиТ)
Научно-исследовательский институт экспертизы и инжиниринга (НИИЭиИ)
Институт комплексной безопасности в строительстве (ИКБС)
Научно-исследовательский институт экспериментальной механики (НИИЭМ)
Научно-исследовательский институт проектирования (НИИП МГСУ)
Институт научно-технического сопровождения строительства (ИНТСС)
Научно-образовательный центр "Теплогазоснабжение и вентиляция" (НОЦ "ТГВ")
Научно-образовательный центр "Гидротехника" (НОЦ "Гидротехника")
Научно-образовательный центр "Наноматериалы и нанотехнологии" (НОЦ НТ)
Научно-образовательный центр "Геотехника" (НОЦ "Геотехника")
Научно-образовательный центр "Водоснабжение и водоотведение" (НОЦ "ВиВ")
Научно-образовательный центр испытания сооружений (НОЦ ИС)
Научно-исследовательский и испытательный центр "МГСУ СТРОЙ-ТЕСТ" (НИиИЦ "МГСУ СТРОЙ-ТЕСТ")
Лаборатория судебных строительно-технических экспертиз и претензионной работы (ЛССТЭиПР)
Научно-исследовательский центр "Надежность и сейсмостойкость сооружений" (НИЦ НиСС)
Научно-исследовательская лаборатория современных композиционных строительных материалов (НИЛ СКСМ)